もしかして別々の航空券で購入したのですか？

もしヴァージンオーストラリアとANAが別々の航空券で、預け荷物をシドニーで一度引き取るのであれば2時間の乗り継ぎではかなり無理があります。
ここによると
https://www.ana.co.jp/ja/us/serviceinfo/international/information/checkin.html
ヴァージンオーストラリアとANAはスルーチェックイン可能と書かれていますので、ゴールドコーストでのチェックイン時に羽田まで行くことを話せば羽田まで荷物を運んでくれるかも知れません。預け荷物がなければ出発が遅れない限りたぶん大丈夫だと思います。