日程が狂っても

飛行機が遅れるなんてよくあることです。
日本出発前ならホテルの日本の窓口へ連絡すればすむことです。
運悪く営業時間外や休日ならサイトからキャンセルするか、直接ホテルへ国際電話してキャンセルすればすむことです。
時差があるのでほとんど国は当日18時までキャンセル可の予約ならほとんど大丈夫です。

何度も直接電話しています。
直接ホテルと話せばホテル側の厚意で何とかなる事多いです。
私は何度も自分のミスでホテル側の厚意で助けられています。

別切りの航空券で乗り継げなければ、乗り継ぎの航空券が変更一切不可なら紙くずになるのと同じです。
自己責任の世界です。

リスクを考えて行動すればよいだけです。
何かあったら自分自身で考えて処理するだけです。
それが嫌ならパッケージツアーを選択すればよいだけです。