もちろん可能です

数ヶ月とか数年先の話はちょっとわかりませんが、数日、数週間でしたら間違いなく可能です。実際に何度も買ってますし、公式サイトのオンライン予約でもできるシステムになっています。

ターボジェット社のサイトで香港（上環）線も九龍（尖沙咀）線も購入可能です。
http://www.turbojet.com.hk/jp/

船酔いに関しては路線ではなく、船のタイプに寄ります。九龍線は全てカタマランという双胴船ですから、横揺れには強いですが、縦揺れの上下動は並に状況により大きい時があります。チェックインの時に後ろの方の座席をリクエストすると揺れは多少マシです。

上環線は旧ジェットフォイル社からの水中翼船は高速浮上中はほとんど揺れはありませんが、湾内に入ると横揺れがかなり大きい時があります。旧ターボキャット社からのカタマランは九龍線と同じです。

どの時間にどの船種が出港するかは大体一定していますが、たまに変更がありますので、確実なことは当日フェリーターミナルで問い合わせるか、電光掲示板を見ないとわかりません。

どうしても水中翼船が良ければ、下記の時刻表のプレミアジェットフォイルなら確実に水中翼船です（普通席もあります）。

http://www.turbojet.com.hk/jp/routing-sailing-schedule/hong-kong-macau/sailing-schedule-fares.aspx