上エジプト行きは、LCCもあります。

エジプト航空国内線アブシンベル行きなどが高いのは、競争がなく、金払いの良い富裕層・外国人観光客が利用するからです。

日本で言えば、JALの国内線非競争路線正規運賃が割高、のようなものでしょうか。

近年では、エジプト国内でもLCCがあり、上エジプトの遺跡好き在留邦人の中には利用者もいます。

：ナイルエアー

https://en.wikipedia.org/wiki/Nile_Air

アブシンベルの路線は現在ありませんが、カイロ・アスワンの路線はあります。

さきほど、こちらのサイトで今月の適当な日付で調べたところ、
・カイロ・アスワン間の往復で　２０００LE前後。　（中間値　１ドル・１７、８LE）

https://eg.flyin.com/

ナイルエアーはときに激安キャンペーンをすることがあり、その時期にあたれば、さらに安いこともあるでしょう。
一方、LCCのデメリットはご存知の通りです。

アスワンからアブシンベルへは、アスワンの各宿が斡旋している日帰りバスツアーを利用するなり、
エジプト航空を利用するなり、お好みで。